1.創(chuàng)建時期(一九五五年至一九五七年)

　　南京市鼓樓區(qū)人民檢察院于一九五五年十一月開始籌建,十二月十日宣告成立,正式對外辦公,辦公地點設在本市中山北路99號。同年十二月十二日,高鴻雁被任命為檢察長。一九五七年底辦公地點遷至本市中山北路97號。其間干部編制由2人增至9人。

　　2.削弱到取消時期(一九五八年至一九七七年)

　　一九五八年至一九六五年,受“左”的思潮干擾,本院業(yè)務、人員逐步被削弱,部分干部調往外系統(tǒng)或被派支援邊疆工作,干部編制減至4-5人。一九六一年辦公地點遷至本市大方巷24號,一九六三年遷至本市中山北路101號。一九六六年進入“文化大革命”時期,本院各項工作陷入癱瘓,干部大部分被下放到本市曉莊林場“五 . 七”干校學習、勞動。一九六八年十二月,南京市鼓樓區(qū)人民檢察院被撤銷,干部分別調至市、區(qū)其他部門工作。

　　3.重建和發(fā)展時期(一九七八年至今)

　　一九七八年十二月根據(jù)中共文件精神,南京市鼓樓區(qū)人民檢察院重建,司秉德?lián)�任檢察長,一九七九年一月一日正式對外辦公,辦公地點設在本市江蘇路39號,其間人員力量得到擴充,至一九七九年底人員編制為34人。一九八零年一月,辦公地點遷至本市中山西路124號,一九八四年十二月遷至南京市水佐崗60-3號,一九八八年二月,遷至南京市云南路24號。二零零二年二月八日遷至南京市定淮門5號,這是自重建檢察院以來,鼓樓區(qū)人民檢察院擁有面積達5600平方米一幢現(xiàn)代化裝飾的新辦公大樓。本院機構、人員、檢察業(yè)務均也得到充分發(fā)展。二零零二年七月院機構改革時在職干警為90人,其中政法專項編88人,行政附屬編為8人。到二零零九年十二月,在職干警95人,其中政法專項編85人,行政附屬編為10人。到二零一三年五月原鼓樓區(qū)人民檢察院與原下關區(qū)人民檢察院合并,新南京市鼓樓區(qū)人民檢察院在職干警167人,其中政法專項編152人,行政附屬編為15人。在南京市定淮門大街5號和南京市中山北路540號兩處辦公。二零一七年八月十八日,根據(jù)鼓編字〔2017〕15號文《關于區(qū)人民檢察院機構編制有關事項調整的通知》,劃轉我院政法專項編制4名,并根據(jù)派駐工作要求,我院不再設紀檢組長一職,領導職數(shù)予以核減,調整后,我院政法專項編制總數(shù)為178名。二零一七年十二月五日,根據(jù)鼓編字〔2017〕33號文《關于推進監(jiān)察體制改革試點工作調整機構編制事項的通知》,劃轉我院政法專項編制49名至區(qū)紀委機關,調整后,我院政法專項編制為129名。同時,撤銷區(qū)人民檢察院反貪污賄賂局及其下設的綜合科、偵查一科、偵查二科、基礎信息科,反瀆職侵權局,職務犯罪預防局。核銷區(qū)人民檢察院反貪污賄賂局局長(副處級)領導職數(shù)1名,正科級領導職數(shù)7名、副科級領導職數(shù)4名。到二零一七年十二月,在職干警151人,政法專項編136人,行政附屬編為15人。